MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 plasmid pP880201

Total Repeats: 1181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013160	GAA	2	6	96	101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818683
2	NC_013160	GAA	2	6	159	164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818683
3	NC_013160	CGT	2	6	212	217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818683
4	NC_013160	TAT	2	6	245	250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818683
5	NC_013160	AAAG	2	8	273	280	75 %	0 %	25 %	0 %	256818683
6	NC_013160	A	6	6	282	287	100 %	0 %	0 %	0 %	256818683
7	NC_013160	TAT	2	6	288	293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818683
8	NC_013160	TTG	2	6	401	406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818684
9	NC_013160	A	6	6	418	423	100 %	0 %	0 %	0 %	256818684
10	NC_013160	TGA	2	6	494	499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818684
11	NC_013160	TAAA	2	8	533	540	75 %	25 %	0 %	0 %	256818684
12	NC_013160	ACTCAA	2	12	956	967	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	256818685
13	NC_013160	ACC	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818685
14	NC_013160	AG	3	6	1067	1072	50 %	0 %	50 %	0 %	256818685
15	NC_013160	TTTTCA	2	12	1124	1135	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256818685
16	NC_013160	CCA	2	6	1164	1169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818685
17	NC_013160	TCG	2	6	1192	1197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818685
18	NC_013160	TG	3	6	1204	1209	0 %	50 %	50 %	0 %	256818685
19	NC_013160	ATA	2	6	1308	1313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818685
20	NC_013160	A	6	6	1438	1443	100 %	0 %	0 %	0 %	256818686
21	NC_013160	TAC	2	6	1484	1489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818686
22	NC_013160	GTT	2	6	1503	1508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818686
23	NC_013160	GCA	2	6	1702	1707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818686
24	NC_013160	ACA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818686
25	NC_013160	CAT	2	6	1914	1919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818686
26	NC_013160	TCG	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818686
27	NC_013160	TGC	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818686
28	NC_013160	ACT	2	6	2067	2072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818687
29	NC_013160	AAC	2	6	2073	2078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818687
30	NC_013160	TAA	2	6	2115	2120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818687
31	NC_013160	GAC	2	6	2211	2216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818687
32	NC_013160	GGT	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818687
33	NC_013160	TCA	2	6	2391	2396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818687
34	NC_013160	CTGAT	2	10	2471	2480	20 %	40 %	20 %	20 %	256818687
35	NC_013160	AAAT	2	8	2512	2519	75 %	25 %	0 %	0 %	256818687
36	NC_013160	TGCTT	2	10	2521	2530	0 %	60 %	20 %	20 %	256818687
37	NC_013160	AGC	2	6	2629	2634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818687
38	NC_013160	C	6	6	3008	3013	0 %	0 %	0 %	100 %	256818688
39	NC_013160	TGG	2	6	3059	3064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818688
40	NC_013160	AAAC	2	8	3164	3171	75 %	0 %	0 %	25 %	256818688
41	NC_013160	CCA	2	6	3193	3198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818688
42	NC_013160	GGAG	2	8	3264	3271	25 %	0 %	75 %	0 %	256818688
43	NC_013160	GTT	2	6	3322	3327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818688
44	NC_013160	CCCA	2	8	3340	3347	25 %	0 %	0 %	75 %	256818688
45	NC_013160	TCAG	2	8	3391	3398	25 %	25 %	25 %	25 %	256818688
46	NC_013160	GAC	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818688
47	NC_013160	TGAA	2	8	3593	3600	50 %	25 %	25 %	0 %	256818688
48	NC_013160	AAT	2	6	3739	3744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818688
49	NC_013160	GGAGC	2	10	3939	3948	20 %	0 %	60 %	20 %	256818688
50	NC_013160	TCA	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818688
51	NC_013160	GACAG	2	10	4017	4026	40 %	0 %	40 %	20 %	256818688
52	NC_013160	ATT	2	6	4043	4048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818688
53	NC_013160	GTC	2	6	4108	4113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818688
54	NC_013160	CTT	2	6	4122	4127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818688
55	NC_013160	GATT	2	8	4152	4159	25 %	50 %	25 %	0 %	256818688
56	NC_013160	CTG	2	6	4302	4307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818689
57	NC_013160	TTGT	2	8	4308	4315	0 %	75 %	25 %	0 %	256818689
58	NC_013160	TGT	2	6	4322	4327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818689
59	NC_013160	AAT	2	6	4437	4442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818689
60	NC_013160	AGC	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818689
61	NC_013160	CAA	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818689
62	NC_013160	CAGA	2	8	4499	4506	50 %	0 %	25 %	25 %	256818689
63	NC_013160	CAAG	2	8	4595	4602	50 %	0 %	25 %	25 %	256818689
64	NC_013160	AAC	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818689
65	NC_013160	GA	3	6	4651	4656	50 %	0 %	50 %	0 %	256818689
66	NC_013160	GCG	2	6	4658	4663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256818689
67	NC_013160	GCT	2	6	4677	4682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818689
68	NC_013160	CTT	2	6	4744	4749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818689
69	NC_013160	CGAGAT	2	12	4773	4784	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256818689
70	NC_013160	CTGC	2	8	4797	4804	0 %	25 %	25 %	50 %	256818689
71	NC_013160	CTGT	2	8	4864	4871	0 %	50 %	25 %	25 %	256818689
72	NC_013160	ATTT	2	8	6292	6299	25 %	75 %	0 %	0 %	256818690
73	NC_013160	AG	3	6	6324	6329	50 %	0 %	50 %	0 %	256818690
74	NC_013160	CTT	2	6	6373	6378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818690
75	NC_013160	ACC	2	6	6381	6386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256818690
76	NC_013160	TCA	2	6	6462	6467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818690
77	NC_013160	ATC	2	6	6570	6575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818690
78	NC_013160	CTT	2	6	6651	6656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818690
79	NC_013160	CTT	2	6	6685	6690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818690
80	NC_013160	CCT	2	6	6726	6731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256818691
81	NC_013160	CAT	2	6	6811	6816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818691
82	NC_013160	TTC	2	6	6940	6945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818691
83	NC_013160	T	6	6	6955	6960	0 %	100 %	0 %	0 %	256818691
84	NC_013160	GTT	2	6	6983	6988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818691
85	NC_013160	AACC	2	8	7002	7009	50 %	0 %	0 %	50 %	256818691
86	NC_013160	AAT	2	6	7037	7042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818691
87	NC_013160	CAG	2	6	7059	7064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818691
88	NC_013160	TGG	3	9	7186	7194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256818691
89	NC_013160	AGC	2	6	7300	7305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818691
90	NC_013160	TTC	2	6	7360	7365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818691
91	NC_013160	T	6	6	7401	7406	0 %	100 %	0 %	0 %	256818691
92	NC_013160	AAG	2	6	7429	7434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818691
93	NC_013160	GTCG	2	8	7436	7443	0 %	25 %	50 %	25 %	256818691
94	NC_013160	GCTT	2	8	7480	7487	0 %	50 %	25 %	25 %	256818691
95	NC_013160	GAACA	2	10	7504	7513	60 %	0 %	20 %	20 %	256818691
96	NC_013160	C	6	6	7573	7578	0 %	0 %	0 %	100 %	256818691
97	NC_013160	TAT	2	6	8938	8943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818692
98	NC_013160	TCTT	2	8	9031	9038	0 %	75 %	0 %	25 %	256818692
99	NC_013160	AAC	2	6	9040	9045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818692
100	NC_013160	CAA	2	6	9078	9083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256818692
101	NC_013160	GAT	2	6	9095	9100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818692
102	NC_013160	TTC	2	6	9112	9117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818692
103	NC_013160	CTT	2	6	9142	9147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818692
104	NC_013160	T	6	6	9151	9156	0 %	100 %	0 %	0 %	256818692
105	NC_013160	TTTGA	2	10	9166	9175	20 %	60 %	20 %	0 %	256818692
106	NC_013160	TTG	2	6	9211	9216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818692
107	NC_013160	GAC	2	6	9240	9245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818692
108	NC_013160	TAC	2	6	9283	9288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256818692
109	NC_013160	T	6	6	9329	9334	0 %	100 %	0 %	0 %	256818692
110	NC_013160	TGC	2	6	9347	9352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818692
111	NC_013160	AAT	2	6	9360	9365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818692
112	NC_013160	T	8	8	9367	9374	0 %	100 %	0 %	0 %	256818692
113	NC_013160	CAAT	2	8	9423	9430	50 %	25 %	0 %	25 %	256818692
114	NC_013160	TCT	4	12	9461	9472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818692
115	NC_013160	T	6	6	9479	9484	0 %	100 %	0 %	0 %	256818692
116	NC_013160	AGC	2	6	9578	9583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256818692
117	NC_013160	TAT	2	6	9603	9608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818692
118	NC_013160	TTC	3	9	9640	9648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818692
119	NC_013160	T	6	6	9708	9713	0 %	100 %	0 %	0 %	256818692
120	NC_013160	CAAT	2	8	9747	9754	50 %	25 %	0 %	25 %	256818692
121	NC_013160	TTG	2	6	9763	9768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818692
122	NC_013160	TAA	2	6	9781	9786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818692
123	NC_013160	TGTT	2	8	9793	9800	0 %	75 %	25 %	0 %	256818692
124	NC_013160	TATT	2	8	9913	9920	25 %	75 %	0 %	0 %	256818693
125	NC_013160	TCTTT	2	10	9925	9934	0 %	80 %	0 %	20 %	256818693
126	NC_013160	TTA	2	6	9963	9968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818693
127	NC_013160	TTG	2	6	10031	10036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256818693
128	NC_013160	TAA	2	6	10126	10131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256818693
129	NC_013160	TGGC	2	8	10162	10169	0 %	25 %	50 %	25 %	256818693
130	NC_013160	TTC	2	6	10178	10183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818693
131	NC_013160	CTT	2	6	10204	10209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818693
132	NC_013160	ATT	2	6	10253	10258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818693
133	NC_013160	GCT	2	6	10312	10317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256818693
134	NC_013160	AG	3	6	11074	11079	50 %	0 %	50 %	0 %	256818694
135	NC_013160	AGT	2	6	11099	11104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256818694
136	NC_013160	AT	3	6	11118	11123	50 %	50 %	0 %	0 %	256818694
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141	NC_013160	GAA	2	6	11340	11345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
142	NC_013160	AGA	2	6	11357	11362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256818694
143	NC_013160	AG	3	6	11364	11369	50 %	0 %	50 %	0 %	256818694
144	NC_013160	GACG	2	8	11380	11387	25 %	0 %	50 %	25 %	256818694
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394	NC_013160	TAT	2	6	23939	23944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256818700
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400	NC_013160	TCAA	2	8	24306	24313	50 %	25 %	0 %	25 %	256818700
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404	NC_013160	TAAG	2	8	25493	25500	50 %	25 %	25 %	0 %	256818701
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406	NC_013160	TTC	2	6	25629	25634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256818701
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